Фамилия Малохатько звучит на украинский лад и сразу обращает на себя внимание суффиксом -ко. В украинской ономастике это один из самых распространённых фамильных формантов, который выполняет ту же роль, что и русские -ов/-ев: он превращает прозвище или имя в фамилию. Значит, перед нами типичная украинская фамилия, образованная от прозвища или имени.

Основа фамилии — «Малохать». Здесь возможны два основных прочтения, и оба ведут к прозвищу. Первое и самое очевидное: «мало хати» — то есть человек, у которого мало дома, или, в переносном смысле, бедняк, не имеющий крепкого хозяйства. В украинском языке «хата» — это дом, жильё. Прозвище могли дать безземельному крестьянину, батраку или тому, кто ютился в тесной лачуге.

Вторая версия, менее распространённая, но тоже возможная: от глагола «хаяти» — осуждать, бранить, хулить. В этом случае «Малохать» — человек, который мало ругает, незлобивый, тихий. Однако первая версия, связанная с домом и достатком, выглядит более убедительной: прозвища, указывающие на имущественное положение, давали часто и охотно.

Суффикс -к- в фамилии Малохатько — уменьшительный, но в фамилиях он утратил своё прямое значение. Он просто указывает на принадлежность: Малохатько — это сын или потомок Малохатя. Такая модель образования (прозвище + -ко) была особенно характерна для Левобережной и Степной Украины, а также для южнорусских областей, где украинское влияние было сильным.

Фамилия довольно редкая. Её географическое распространение — в основном Украина, особенно центральные и восточные области, а также юг России (Кубань, Ростовская область), куда украинские крестьяне переселялись в XVIII–XIX веках. Встречаются варианты написания: Малохатько и реже Малохатко (без мягкого знака), что объясняется особенностями произношения в разных говорах.

Сословно предки-носители этой фамилии, скорее всего, были казаками или государственными крестьянами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это фамилия простого люда, где прозвище говорило само за себя.