Фамилия Малонухин — редкая и неочевидная с первого взгляда. Если отбросить суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?» — сын Малонухи), остаётся основа Малонух-. Она не похожа на типичное прозвище от имени или профессии, поэтому здесь стоит разобраться в словообразовательной логике.

Скорее всего, в основе лежит древнерусское имя или прозвище Малонух. Первая часть — «мало-» (то есть «небольшой», «младший»). Вторая часть — «-нух» — может быть диалектным вариантом от «нужда» или «нудить» (принуждать, заставлять). В северных и сибирских говорах «нух» встречалось в значении «нужда, горе, беда». Тогда Малонух — человек, которого «малая нужда» не пугала, либо, наоборот, прозвище бедняка, у которого «мало нужды» (ирония). Такие составные прозвища с отрицательной или уменьшительной приставкой типичны для русской антропонимии XVI–XVII веков: Маловолос, Малобесов, Малоголов.

Есть и другая, менее вероятная версия: от канонического имени Мануил (с перестановкой слогов и народной переделкой). В крестьянской среде имя Мануил нередко сокращали до Мануха, Маноха, а под влиянием аканья и переосмысления «мало» могло возникнуть Малонух. Но это уже гипотеза, требующая документального подтверждения.

Фамилия Малонухин зафиксирована в основном в центральных и южных регионах России — в Тульской, Рязанской, Воронежской областях. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении от одного прозвища или рода. По модели образования фамилия относится к типичным русским «патронимическим» (по отцу), но с нестандартной основой, что делает её интересным объектом для этимолога.

Если ваши предки носили фамилию Малонухин, скорее всего, они были крестьянами или посадскими людьми, а родоначальник получил прозвище за какой-то характерный признак или жизненную ситуацию — возможно, за невысокий рост или за скромный достаток. Точную дату возникновения фамилии установить сложно, но, судя по суффиксу, она оформилась не позднее XVII века.