Фамилия Малтасар — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение, скорее всего, не славянское, а западноевропейское или, точнее, балтийское. Если разложить слово на составляющие, в основе лежит древнепрусский или литовский корень. Первая часть «Малт-» восходит к литовскому «malti» — «молоть», «размалывать». Вторая часть «-сар» — это, вероятно, литовское «saras» (список, перечень) или, что более правдоподобно, искажённое «sargis» (сторож, страж) либо «saris» (воин, всадник). Таким образом, исходное прозвище Малтасар могло означать «мельничный сторож» или «человек, ведающий учётом помола» — должность при мельнице в литовских или прусских землях.

Суффикс в фамилии нулевой (основа без типичных русских -ов, -ин). Это указывает на то, что фамилия закрепилась в таком виде либо у балтийских народов (литовцев, латышей, пруссов), либо у поляков, которые нередко заимствовали литовские прозвища без изменений. В русскую среду фамилия Малтасар могла попасть вместе с переселенцами из Великого княжества Литовского или из Курляндии. В этом случае её носителями были не крестьяне, а скорее служилые люди или ремесленники, имевшие отношение к мельничному делу.

География фамилии сегодня крайне узкая. Малтасары встречаются преимущественно в Литве и на западе Беларуси, изредка — в Латвии. В России эта фамилия единична и фиксируется в основном в Калининградской области (бывшая Восточная Пруссия) и у потомков литовских переселенцев в Сибири. Написание фамилии устойчивое, без вариантов, что говорит о её поздней фиксации в документах (XIX век), когда грамотность уже не допускала сильных искажений.

С точки зрения социального контекста, фамилия Малтасар — не дворянская и не купеческая. Она относится к числу прозвищных, профессиональных, и её носители в прошлом, скорее всего, были людьми небогатыми, но имевшими определённый статус при мельнице или на транспорте. В прусских и литовских метриках XVII–XVIII веков можно найти упоминания о Малтасарах как о «вольных людях» (не крепостных), работавших по найму.

Однокоренных фамилий в русском языке практически нет. Можно вспомнить разве что фамилию Малтас (без «-ар»), которая встречается у литовцев и означает того же «мельника». Различие в суффиксе «-ар» могло возникнуть из-за польского влияния (польск. «młynarz» — мельник), но в форме Малтасар это скорее сложное слово, а не прямая калька. Таким образом, фамилия Малтасар — яркий пример балтийского профессионального прозвища, сохранившегося почти без изменений в русскоязычной среде.