Фамилия Мамукаева — одна из тех, что пришли в русский ономастикон из тюркской среды. Её основа — мужское имя Мамукай, которое само по себе составное. Первая часть, Мамук, — это диалектный вариант имени Мухаммет (Мухаммад). С арабского оно переводится как «восхваляемый, прославляемый», что отсылает к пророку и является одним из самых распространённых имён в исламском мире. Вторая часть имени — «ай» — восходит к древнетюркскому слову, означающему «месяц». Таким образом, имя Мамукай можно понимать как «прославляемый месяц» или «месяц Мухаммада» — образ, характерный для тюркской поэтической традиции, где луна символизирует красоту и свет.

По словообразовательной модели фамилия Мамукаева — это типичный русифицированный патроним. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Мамукаев буквально значит «сын Мамукая». Окончание -а — женская форма, то есть носительница фамилии — потомок человека по имени Мамукай. Такая модель закрепилась в XIX–XX веках, когда тюркские фамилии адаптировались к русской грамматике.

Фамилия довольно редкая. Её географическое распространение связано с регионами, где исторически жили тюркоязычные народы: Северный Кавказ (особенно Чечня и Ингушетия), Поволжье (татары, башкиры). Встречается она и у ногайцев. Встречаются варианты написания — Мамукаев (мужская форма) и Мамукаева (женская), но корень везде один.

Точное время возникновения фамилии установить сложно. Процесс закрепления наследственных фамилий у разных народов шёл неравномерно: у горцев Кавказа — преимущественно в конце XIX — начале XX века, у татар — чуть раньше. Без серьёзных генеалогических изысканий определить конкретный род и век появления фамилии Мамукаева невозможно.