Фамилия Манглиев — редкий случай, когда географическая привязка оказывается едва ли не единственной убедительной версией происхождения. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён или профессий, Манглиев почти наверняка ведёт родословную не из центральной России, а из тюркоязычных регионов или Кавказа.

Основа фамилии — имя или прозвище Мангли. В тюркских языках слово «ман» может означать «родинка», «пятно», а «гли» — суффикс обладания. Соответственно, Мангли — «имеющий родинку», «пятнистый». Такие прозвища давали по заметной примете на теле. У тюркских народов (татар, башкир, ногайцев) и у народов Северного Кавказа (чеченцев, ингушей) имя Мангли встречается как мужское, хотя в некоторых диалектах оно могло быть и женским.

Фамилия образована по русской модели с патронимическим суффиксом -ев: Манглиев — «сын Мангли». Это типичная ситуация для народов, вошедших в состав Российской империи, когда при переписях и в документах к местным именам добавляли русское окончание. Суффикс -ев, а не -ин, указывает на то, что основа оканчивается на согласный или мягкий знак.

Стоит отметить, что фамилия Манглиев не входит в число распространённых. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она практически не встречается за пределами Астраханской губернии, Оренбуржья и Терской области. Это косвенно подтверждает её «окраинное» происхождение: там, где осевшие тюрки или горцы получали фамилии по отцу.

В современной России фамилия встречается редко, в основном у татар, башкир, чеченцев. Встречаются варианты написания с одной «л» (Мангиев) — это следствие упрощения при записи в советских паспортных столах. Спорных версий, связывающих Мангиева с греческим или славянским корнем, нет — они настолько слабы, что всерьёз не рассматриваются ономастами.