Фамилия Маглиева образована от прозвища или имени Магли, которое, скорее всего, имеет тюркское происхождение. Эта фамилия вписывается в ряд известных русских фамилий, ведущих начало от тюркских прозвищ: Тургенев от Турген («быстрый, скорый»), Аксаков от Аксак («хромой»), Булгаков от Булгак («беспокойный»). Вероятно, и в основе Маглиева лежит прозвище, характеризовавшее человека по какой-то яркой черте или роду занятий.

Сама основа — Магли — может восходить к тюркскому слову «маглы» или «магли», что в разных диалектах означает «туманный», «пасмурный» или «задумчивый, печальный». В переносном смысле так могли назвать неразговорчивого, угрюмого человека либо того, кто постоянно ходил с задумчивым видом. Встречается и другая версия: связь с арабским именем Магли (Маглий) — одной из форм имени Махмуд или Мухаммад, распространённой у народов, исповедующих ислам. В таком случае фамилия образована от мусульманского личного имени.

Фамилия Маглиева образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или -й. Суффикс указывает на принадлежность: Маглиев — «сын Магли» или «из рода Магли». Такая модель типична для фамилий, возникших в среде крещёных татар, башкир или других тюркских народов, которые входили в состав Российского государства и принимали православие. Фамилия могла появиться в XVI–XVII веках, когда активно шёл процесс русификации нерусского населения Поволжья и Приуралья.

Сегодня фамилия Маглиева встречается нечасто. Основные очаги её бытования — регионы с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области, а также в среде кавказских народов (например, у аварцев или кумыков), где тюркские и арабские имена также были распространены. Сравнительно редкое распространение делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы носите эту фамилию, ваши предки, скорее всего, происходят из тюркоязычной среды, возможно, из татарских или башкирских родов, принявших христианство или сохранивших ислам.