Фамилия Манихина образована от прозвища Маниха. Оно берет начало от глагола «манить» со значением «звать, обнадеживать, обещать». Вероятно, именование Маниха указывает на особенности характера его обладателя. Так могли назвать красноречивого, умеющего убеждать и настаивать на своем человека. Возможно также, что фамилия Манихина происходит от имени Маниха. Оно, предположительно, представляет собой производную форму имени Мануил (Иммануил), которое в переводе с древнееврейского означает «с нами Бог». Скорее всего, основатель рода Манихиных был человеком из простого сословия. Так и прозвище Маниха закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Манихин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Маниха, со временем получил фамилию Манихин.