Фамилия Манина образована от женского имени Мария. Это имя пришло в русский язык из древнееврейского и означает «любимая, желанная; госпожа». Основой же для фамилии послужила его просторечная форма – Маня. В результате, потомок женщины, обладающего именем Маня, со временем получил фамилию Манина. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Маниных можно лишь на основании генеалогических исследований.