Фамилия Маниховы — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, образованное от глагола «манить». Исходное слово — «маних», то есть тот, кто манит, завлекает, обольщает. В старых говорах «манихой» или «манухой» могли называть не просто обманщика, а человека, который умело уговаривает, заманивает в гости, обещает небывалое — этакий хитрец-соблазнитель. Менее вероятно, но возможно, что прозвище давали и тому, кто сам легко поддавался на уговоры, был доверчивым.

Словообразовательная модель проста и типична для русских фамилий: основа «Маних» плюс патронимический суффикс «-ов», указывающий на принадлежность роду. Манихов — буквально «сын Маниха». Суффикс «-их-» в форме «Маниховы» (множественное число) указывает на целый род, семейство. Фамилия относится к самому массовому типу русских фамилий, которые в XV–XVII веках получали крестьяне и посадские люди по имени или прозвищу отца.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским областям. Встречается в старых переписях Воронежской, Тамбовской и Саратовской губерний. В этих регионах слово «манить» имело ярко выраженный оттенок «обманывать, вводить в заблуждение», что делает прозвище нелестным, но живым — в крестьянской среде такие меткие прозвища давали за характер, а не за род занятий.

Любопытно, что фамилия Маниховы не имеет отношения к манихейству — древней религии. Случайное созвучие сбивает с толку, но ономастика здесь однозначна: корень чисто славянский, глагольный. Встречаются также варианты написания через «я» — Манихов, но это уже следствие акающего произношения, а не другая этимология.