Фамилия Манцинова — одна из тех, где при первом взгляде на окончание можно ошибиться с выводом. Формально это женская форма, но на практике фамилия закрепилась именно в таком виде, и её носительницы — женщины, а мужской вариант будет Манцинов. Впрочем, в разговорной речи и документах встречается и неизменяемая форма Манцинова, что нередко для фамилий на -ов, застывших в женском роде.

Корень фамилии, скорее всего, восходит к прозвищу или имени Манца. На Кавказе и в Поволжье, особенно среди калмыков и народов, испытавших тюркское влияние, «манц» или «манца» могло означать либо «маленький», «крошка» (от калмыцкого «манц» — кроха), либо быть вариантом имени Манчи, Манжур. В русском контексте основа могла произойти от диалектного «манцевать» — медлить, мешкать, что давало прозвище Манца нерасторопному человеку. Есть и версия, что это вариант фамилии Манцинов от имени Мануил через народную форму Манца, но она менее вероятна из-за редкости такого стяжения.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Манцинов — «чей?» — сын или потомок Манцы. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. Если же фамилия происходит от калмыцкого корня, то суффикс -ов мог быть добавлен при русификации, но в данном случае -ин говорит о более раннем и органичном вхождении в русскую ономастику.

Географически фамилия редкая. Основные следы ведут на юг России: в Ростовскую область, Ставрополье, а также в Калмыкию, где фамилия встречается у калмыков и русских старожилов. Встречается и в Сибири, куда её могли занести переселенцы. Сословно предки могли быть крестьянами или казаками, так как фамилии на -ин от прозвищ характерны для простонародья, а не для дворянства.

Таким образом, Манцинова — фамилия с неоднозначным, но компактным корнем. Её носители, скорее всего, происходят от человека, которого в округе называли Манцей — либо за малый рост, либо за привычку мешкать, либо по имени. Точное значение зависит от региона, но в любом случае это прозвищная фамилия, а не от крестильного имени.