Скорее всего, фамилия Манютина образована от просторечной формы распространенного женского имени Мария – Маша, Манюта. В переводе с древнееврейского оно означает «любимая, желанная», «госпожа». Менее вероятно, что Манюта — это производная форма имени Эммануил, которое в переводе с древнееврейского означает «с нами Бог». По другой версии, в основе фамилии Манютина лежит не имя, а прозвище Манюта, этимологически связанное со славянским глаголом «манить» - «звать посулами», «дразнить, обманывать», «ждать, дожидаться» или «мешкать, медлить». Таким образом, это прозвище могло указывать на особенности характера или поведения предка. В результате, потомок женщины, обладающей именем Манюта, со временем получил фамилию Манютина. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Манютиных можно лишь на основании генеалогических исследований.