Фамилия Маракушин образована от прозвища Маракуша — это типичная для русских фамилий модель с суффиксом -ин, указывающая на принадлежность («чей сын?»). Основа прозвища неоднозначна, и здесь возможны два противоположных толкования, которые стоит разобрать подробнее.

Первая версия отсылает к глаголу «мараковать». В старину у этого слова был раздвоенный смысл: оно могло означать как «плохо понимать, с трудом соображать», так и «уметь, мочь, разбираться в деле». То есть Маракушей могли назвать и человека тугодума, и, наоборот, толкового мастера со смекалкой. Вторая версия связывает прозвище с глаголом «марать» — пачкать. Тогда Маракуша — человек, занятый грязной работой: кочегар, трубочист, золотарь. Обе версии имеют право на жизнь, но первая, с «мараковать», встречается в источниках чаще и имеет больше диалектных параллелей.

Интересно, что одна из самых ранних документальных записей этой фамилии относится ко второй половине XVI века. В трудах историка С. Б. Веселовского упомянут Маракушев Рудный Григорьевич, живший в Угличе. Обратите внимание на необычное отчество — Рудный (от «руда», то есть кровь, или от рудокопа). Это косвенно может указывать на ремесленную или промысловую среду, из которой вышли первые Маракушины.

Таким образом, ваш предок по прозвищу Маракуша был человеком либо с нестандартным складом ума, либо с грязными руками, но в любом случае — личностью, которая запомнилась окружающим. Фамилия закрепилась на севере и в центральной России, особенно в бывших ярославских и костромских землях.