Фамилия Маратканова образована от имени Мараткан — диалектной формы мужского тюркского имени Маратхан. Как и многие восточные имена, оно составное. Первая часть восходит к арабскому имени Мурат (в диалектном произношении — Марат), что означает «цель, намерение, желание; желанный». Вторая часть — «хан» (князь, правитель). Вместе имя Маратхан буквально переводится как «цель (или намерение) хана». Имя Мараткан, таким образом, — это тот же Маратхан, только с уменьшительно-ласкательным тюркским суффиксом -кан, который придаёт имени оттенок близости или младшего возраста.

Фамилия Маратканова — женская форма, а мужская — Маратканов. Она закрепилась за потомками человека по имени Мараткан по стандартной русской модели: к основе имени добавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Мараткана). Со временем фамилия перестала осознаваться как отчество и стала наследственной.

Географически фамилия тяготеет к регионам Поволжья и Урала, где исторически были сильны тюркско-русские контакты. Встречается в Татарстане, Башкортостане, Марий Эл, а также в Кировской и Свердловской областях. Это не случайно: имя Маратхан (и его вариант Мараткан) бытовало именно в среде татар и башкир, а затем, через браки и соседство, перешло в русские семьи.

Из известных носителей — Вячеслав Анатольевич Маратканов (род. 1975), председатель регионального отделения партии «Правое дело» в Республике Марий Эл. Его фамилия — прямое указание на то, что предки жили в зоне активного взаимодействия славянской и тюркской культур.

Таким образом, фамилия Маратканова — не просто семейное имя, а документ, запечатлевший в себе восточное имя, русскую модель отчества и историю межэтнических связей.