Фамилия Маратканов образована от имени Мараткан, диалектного варианта мужского тюркского имени Маратхан. Имя Маратхан, как и многие восточные имена, состоит из двух частей. Первая из них восходит к имени Марат, которое является диалектной формой арабского имени Мурат - «цель, намерение, желание; желанный». Таким образом, буквально имя Маратхан переводится как «цель, намерение хана». Таким образом, потомок человека, которого звали Мараткан, со временем получил фамилию Маратканов. Известным представителем фамилии является Вячеслав Анатольевич Маратканов (род. 1975 г.) - председатель регионального отделения партии «Правое дело» в Республике Марий Эл.