Фамилия Маргарянц — редкий случай, когда по написанию можно почти безошибочно определить, откуда родом предки. Конечное -нц (а не -янц или -ян) — это верный признак армянской фамилии, сформировавшейся в среде армянской диаспоры, говорившей на западноармянском языке или его диалектах. В классическом восточноармянском (на котором говорят в современной Армении) патронимический суффикс выглядит как -ян. Западноармянский вариант — -янц, а его сокращённая форма — -нц. Иными словами, Маргарянц — это «из рода Маргарянов» или, что точнее, «принадлежащий потомку Маргара».

Основа фамилии — личное имя Маргар. В отличие от более привычного Маркар (которое восходит к евангельскому Марку), Маргар — это армянская форма имени Маргарит (в переводе с греческого — «жемчуг»). Имя было распространено как мужское, хотя в русской традиции ассоциируется исключительно с женским. Так что первый носитель фамилии, скорее всего, был назван в честь святого или просто в честь редкого «драгоценного» имени, которое должно было принести счастье и богатство.

Географически фамилия Маргарянц (и её однокоренные Маргарян, Маргаров) чаще всего встречается в среде армян, переселившихся в XIX веке из Западной Армении (территории современной Турции) в города юга России и Закавказья. Многие носители такой фамилии были ремесленниками или торговцами, но социальный статус предка определить сложно: имя Маргар не было ни княжеским, ни крестьянским — оно могло встретиться в любом сословии.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: личное имя Маргар + патронимический суффикс -янц (в редуцированной форме -нц). Если бы фамилия образовалась в Восточной Армении, она звучала бы как Маргарян. Разница в одну букву — а за ней разная историческая судьба: Западная Армения, диалект, эмиграция. Именно эта деталь делает Маргарянц более ценной для ономастики, чем десятки тысяч однотипных фамилий на -ян: она — живой маркер диаспорального происхождения.