Фамилия Маркарьянц — яркий пример армянской фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -янц (или -ян). Этот суффикс указывает на принадлежность к роду, буквально «из дома такого-то». В данном случае основа — личное имя Маркар, которое является армянской формой имени Марк (от латинского Marcus, предположительно «посвящённый Марсу» или «молот»). Таким образом, Маркарьянц означает «потомок Маркара» или «из рода Маркара».

Главная особенность, отличающая эту фамилию от более распространённых армянских фамилий на -ян, — окончание -ьянц. Вариант на -янц (с конечным -ц) характерен для западных диалектов армянского языка, в частности для носителей из Западной Армении (исторические области в современной Турции) или армянской диаспоры, которая сложилась после геноцида 1915 года. В то время как фамилия Маркарьян (с окончанием -ян) встречается чаще, форма Маркарьянц — более редкая и географически привязанная к выходцам из западных регионов, часто осевшим в Краснодарском крае, Ростовской области или в странах Европы и Ближнего Востока.

Само имя Маркар в армянской традиции не было редким. Его носили как простые ремесленники и крестьяне, так и представители духовенства. В ономастике нет единого мнения, было ли имя Маркар в Армении исключительно христианским (от апостола Марка) или могло восходить к местным дохристианским корням, но наиболее убедительная версия — библейская, через греческое посредство. Род занятий предка по этой фамилии определить невозможно: имя не указывает на профессию, а лишь на имя отца или деда.

Если сравнивать с однокоренными русскими фамилиями (Марков, Маркин, Марковцев), то армянский вариант Маркарьянц стоит особняком: он сохранил полную основу имени с суффиксом -ар (уменьшительно-ласкательная или просторечная форма) и армянский патронимический формант. В русском языке фамилия склоняется как существительное мужского рода с нулевым окончанием: Маркарьянц, Маркарьянца, Маркарьянцу. Женский вариант не склоняется.