Фамилия Маршагин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: основа плюс суффикс -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Маршагин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Маршага. А вот с происхождением самой основы — Маршаг — всё не так очевидно, и здесь стоит разобрать несколько версий.

Самая прямая версия — фонетическое искажение тюркского слова «маршак» или «маршаг», которое в некоторых диалектах означало «ловкий, проворный, быстрый». В русских говорах, особенно в южных и поволжских регионах, где было сильное татарское и башкирское влияние, такое прозвище могли дать расторопному человеку или хорошему ходоку. Подтверждение этой версии — существование фамилий Маршаков, Маршаковский, а также топонимов вроде села Маршаги в Башкортостане. География бытования фамилии Маршагин (чаще всего в Пермском крае, Кировской области и на Урале) говорит в пользу именно этого корня: это зона активных контактов русского и тюркского населения.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «марша́ть» (или «маршыхать»), которое в архангельских и вятских говорах означало «бродить, шататься, слоняться без дела». В этом случае Маршагой называли непоседливого человека, бродягу. Однако эта версия слабее, потому что глагол имеет узкое региональное хождение, а фамилия Маршагин встречается шире, чем этот говор.

Третья, самая редкая гипотеза — от имени Маршак, которое могло быть уменьшительной формой от крестильного имени Марк или Маркел (через промежуточные формы Марша, Маршко). Но для русского именослова такое стяжение нехарактерно, и эта версия уступает тюркской по убедительности.

Сословно фамилия Маршагин, скорее всего, относится к крестьянской или мещанской среде. В ревизских сказках и метрических книгах XIX века Маршагины встречаются среди государственных крестьян Вятской и Пермской губерний. Никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её «низовое», прозвищное происхождение.

Интересная деталь: написание фамилии устойчиво — через «а» во втором слоге. Варианты «Моршагин» или «Мершагин» встречаются в единичных случаях и, скорее всего, являются результатом ошибок писарей, которые, не зная тюркского корня, пытались осмыслить фамилию на русский лад (например, от слова «моршень» — морщина). Но историческая норма — Маршагин, и именно она сохранилась до наших дней.