Фамилия Марыконь — редкая и неочевидная для русского уха. В ней нет привычного суффикса -ов или -ин, который сразу указывает на отчество. Окончание -онь не типично для русской ономастики, но встречается в фамилиях польского или белорусского происхождения. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища или личного имени через уменьшительно-ласкательный суффикс -онь, который в польском и западнорусском говорах мог придавать слову оттенок «маленький», «милый» или «свой».

Основа «Марык-» почти наверняка восходит к имени Марык — народной форме христианского имени Марий или Марк. В польском языке имя Mariusz (Мариуш) в бытовом общении могло сокращаться до Maryk, а в белорусском и украинском варианте — до Марык. Тогда Марыконь — это «маленький Марык» или «сын Марыка». Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: основа связана с диалектным словом «марыкать» — говорить невнятно, мямлить. В таком случае прозвище Марык могли дать неразговорчивому или медлительному человеку, а фамилия Марыконь означала бы «потомок Марыка-мямли».

Географически фамилия тяготеет к западным областям — к современной Беларуси, восточной Польше, а также к западу России (Смоленщина, Брянщина). В этих краях суффикс -онь (как в фамилиях Бобрыконь, Козаконь) встречается чаще, чем в центральной России. Социально носители такой фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами — фамилия не дворянская, без форманта -ский, что указывает на простое происхождение.

В написании «Марыконь» примечательна буква «ы» — она выдаёт западнорусскую или белорусскую фонетику, где «ы» произносится твёрже, чем «и». Если бы фамилия писалась через «и» (Мариконь), это указывало бы на южнорусское или украинское влияние. Так что написание через «ы» — дополнительный маркер того, что фамилия оформилась в зоне смешения польского и восточнославянского языков.

Однозначного ответа, кем был первый носитель, нет, но наиболее правдоподобная версия: предок носил имя или прозвище Марык, а фамилия возникла как «малый Марык» или «Марыков сын» в западных губерниях Российской империи.