Фамилия Мацута — редкий случай, когда географический разброс сразу подсказывает основную версию происхождения. Она встречается в Беларуси и на западе России, но особенно плотно — на Кубани и в Краснодарском крае. Это указывает на южнорусскую или украинскую основу, а не на польское или балтийское влияние, которое можно было бы заподозрить по форме на «-ута».

Ключ к разгадке — суффикс «-ута». В восточнославянской ономастике он редко образует фамилии напрямую. Чаще он встречается в украинских прозвищах и именах с уменьшительно-ласкательным или, наоборот, пренебрежительным оттенком (ср. Мишута, Ванюта, Петрута). Значит, основа «Мац-» — это производное от имени Матвей (в украинском и белорусском вариантах — Мацей, Маць, Мацко). Мацута, таким образом, могло быть домашним именем сына или младшего родственника: «Мац (Матвей) + ута» = «маленький Матвей» или «Матвеев сынок».

Есть и вторая, менее вероятная, но не отбрасываемая версия. В некоторых говорах «мацать» означает «щупать, трогать руками». Прозвище Мацута могли дать человеку с назойливой привычкой или, наоборот, слепому, который «мацает» пространство. Однако эта гипотеза слабее: глагольные прозвища обычно образуются через суффикс «-а» (Маца) или «-ай» (Мацай), а «-ута» — это всё-таки именной суффикс.

Фамилия недворянская, без суффикса «-ский», что указывает на крестьянское или казачье происхождение носителей. На Кубани, куда в XIX веке переселяли малороссийских казаков и крестьян, фамилия могла закрепиться именно в форме прозвища, которое позже стало наследственным. Никаких известных исторических деятелей или знатных родов с фамилией Мацута не зафиксировано — это фамилия простого человека, чей предок звался Матвеем, а в семье его называли ласково: Мацута.