Фамилия Матюниа — редкий случай, когда на слух кажется, что перед нами суффиксальное образование, а на деле мы имеем дело с чистой основой. В русской ономастике фамилии на -иа почти не встречаются в исконной модели; это скорее признак искусственного или книжного происхождения, либо результат адаптации иноязычной фамилии к русскому написанию.

Если отбросить редкое окончание, основа «Матюн» прозрачна. Это производная форма от крестильного имени Матвей (древнееврейское Маттитьяху — «дар Яхве»). В народной речи имя давало множество уменьшительных вариантов: Матюня, Матюха, Матюша. Форма «Матюн» — та же, что и Матюня, но без конечного -я, и именно она легла в основу фамилии. Типичный путь: прозвище или домашнее имя Матюн, затем фамилия Матюнин (с суффиксом -ин) — так появились распространённые Матюнины. Но здесь суффикса нет, окончание -иа стоит прямо на корне.

Самая вероятная версия: фамилия Матюниа — результат поздней фиксации или канцелярской ошибки при записи. В XIX — начале XX века, когда крестьянам массово присваивали фамилии, писарь мог записать прозвище Матюня на слух, но по аналогии с греческими или латинскими окончаниями (как в фамилиях типа Георгиа, Илиа) добавил -иа. Второй вариант: перед нами белорусская или украинская фамилия, где суффикс -иа встречается чаще, но даже там он редок и обычно указывает на западнославянское влияние.

В любом случае, значение фамилии сводится к имени предка — человека по прозвищу Матюн, то есть Матвей. Социальный контекст: скорее всего, крестьянская или мещанская среда, где имя Матвей было одним из самых распространённых. Географически фамилия могла закрепиться на юге России или в Беларуси, где мягкое окончание -я в прозвищах нередко переходило в книжное -иа.

Известных носителей с такой фамилией в открытых источниках не зафиксировано — это указывает на её крайнюю малочисленность. По сути, Матюниа — это локальный вариант фамилии Матюнин, застывший в необычной орфографической форме.