Фамилия Матюнины образована от старинного русского имени Матюня — ласковой, обиходной формы крестильного имени Матвей. В переводе с древнееврейского оно означает «человек Божий» или «дар Бога». Такие уменьшительные формы имен на Руси были повсеместны: в быту Матвея звали Матюней, и это прозвище-имя легко переходило на его детей и внуков, отвечая на вопрос «чьи вы будете?» — Матюнины.

Суффикс -ин указывает на принадлежность конкретному человеку, то есть буквально фамилия значит «дети, потомки Матюни». Это типичная модель русских фамилий, образованных от нецерковных, домашних форм имен, и в этом смысле Матюнины стоят в одном ряду с Ваниными, Петюниными или Гришиными.

Среди Матюниных есть дворянский род, который ведет свою историю с начала XVII века. Род внесен в VI часть родословных книг Казанской и Симбирской губерний — это как раз та часть, куда записывали древнее столбовое дворянство, чье благородное происхождение подтверждалось за сто и более лет до реформ Петра I. К этому роду принадлежал Андрей Ефимович Матюнин (1810–1885), занимавший высокие посты: он был обер-прокурором 3-го департамента Правительствующего сената, затем сенатором и первоприсутствующим гражданского кассационного департамента. Карьера в Сенате в XIX веке означала огромный вес в судебной и административной системе империи, так что представитель этой ветви поднялся до самых верхов чиновной иерархии.

Стоит оговориться: дворянство — лишь одна ветвь большого древа. Сама модель фамилии слишком распространена, чтобы все Матюнины происходили от одного родоначальника. Крестьяне и горожане, носившие имя Матюня, получали ту же фамилию независимо друг от друга в разных уездах. Поэтому современные Матюнины могут иметь как общее происхождение с симбирскими дворянами, так и совершенно отдельные корни в других губерниях.

Само имя Матюня звучит по-домашнему тепло, и в этом вся суть фамилии: она сохранила ту форму имени, которую использовали в семье, а не в церкви или официальных бумагах. Так что за фамилией стоит не просто имя, а живая традиция называть близкого человека сокращенно, ласково, по-свойски.