Фамилия Маячкина — женская форма фамилии Маячкин. Разбирать её стоит через мужской вариант, поскольку в русской традиции фамилии образовывались от имени или прозвища отца. Основа здесь — не слово «маяк» в его современном значении, а скорее прозвище Маячок или Маячка.

Вероятнее всего, корень восходит к глаголу «маяться» — страдать, испытывать нужду, мучиться. В диалектах «маяк» и «маячка» означали человека, который постоянно в хлопотах, бедствует или суетится. Это не про навигационный знак, а про бытовое, народное прозвище. В словаре Владимира Даля «маяться» — «биться, колотиться, перебиваться», а «маяк» в переносном смысле — беспокойный, хлопотун.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Маячкин — сын Маячки. То есть фамилия образована от прозвища отца, которое закрепилось за потомками. Такая модель типична для русских фамилий XVI–XVII веков, особенно в центральных и северных губерниях.

Встречается фамилия Маячкин (и Маячкина) в основном в Поволжье и на юге России, по данным переписей XIX века — в Саратовской, Тамбовской и Воронежской губерниях. Это говорит о крестьянском происхождении: носители фамилии были, скорее всего, государственными или помещичьими крестьянами, а не дворянами.

Есть и другая, менее убедительная версия: связь с уменьшительной формой имени Май (от Матвей или Максим). Но имя Май в народной среде было редким, а прозвище от «маяться» — куда более естественным для человека, чья жизнь проходила в тяжелом труде. Поэтому первая гипотеза выглядит предпочтительнее.

В написании фамилии встречается вариант Маячкин с одной «ч», что соответствует правилам русской орфографии: от «маяк» через суффикс -к- получается «маячок», а затем «Маячкин». Двойной «ч» не бывает, так что ошибки в документах редки.