Фамилия Майнина — женская форма, указывающая на принадлежность роду Майниных, то есть потомкам человека по прозвищу или имени Майна. Сама основа фамилии неоднозначна, и у неё есть как минимум три версии происхождения, каждая из которых ведёт к разным прозвищам.

Первая версия связывает прозвище Майна с украинским прилагательным «майний» — «широколиственный». В этом случае прозвище могли дать человеку за его широкоплечесть, крупное телосложение или, возможно, за род занятий, связанный с лесом или листвой. Вторая версия отталкивается от слова «майна» — названия птицы семейства скворцовых. Такое прозвище мог получить либо человек с голосом, напоминающим птичий, либо тот, кто был подвижным, говорливым. Птица майна известна в южных регионах, поэтому эта версия географически привязана к Украине, югу России и Причерноморью.

Третья, менее очевидная версия, выводит прозвище из глагольных форм: «майнувати» — «быстро ехать, мчать» или «майнути» — «махнуть». В этом случае прозвище Майна или Майнуга могло закрепиться за торопливым, порывистым человеком, либо за тем, кто часто махал рукой в жесте или работе. Эта версия объясняет и возможный суффикс -уг- в мужской форме Майнуга, который мог предшествовать фамилии Майнина.

С точки зрения словообразования, фамилия Майнина построена по типичной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Майнина, то есть дочь или жена Майны. Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от слов мужского рода, оканчивающихся на -а или -я. Таким образом, в основе лежит именно мужское прозвище или нецерковное имя Майна.

Географически фамилия Майнина встречается редко, что говорит о её локальном происхождении. Скорее всего, она сформировалась на южнорусских или украинских территориях, где были в ходу и слово «майний», и птица майна, и глагол «майнувати». Сословно предки Майниных могли быть крестьянами или казаками — в этих средах прозвища часто давали по внешним приметам, поведению или местным диалектным словам.