Фамилия Мегер — редкий случай в русской ономастике, где короткая основа и отсутствие типичного фамильного суффикса указывают на позднее заимствование или нестандартное происхождение. В отличие от массовых фамилий на -ов, -ев или -ин, Мегер не имеет патронимического окончания, что сразу выдает в ней либо прозвищное образование, либо иноязычный корень.

Самый прямой путь — прозвище «Мегер» от диалектного слова. В северных и сибирских говорах «мегерой» называли сварливую, бранчливую женщину (от греческого имени Мегера, одной из эриний в мифологии). Однако мужская фамилия Мегер могла закрепиться за человеком с тяжелым характером, склонным к спорам. Версия правдоподобна, но есть и другой вариант — отчество от редкого канонического имени Мегир (Мегирий), которое встречалось в святцах, но почти вышло из употребления. В этом случае фамилия сохранила бы имя предка в чистом виде, без суффикса, что нетипично для русской традиции, но возможно в среде старообрядцев или при поздней фиксации фамилии.

Еще одна версия — географическая. На карте России есть несколько топонимов Мегер: деревня в Вологодской области, река в Карелии. Фамилия могла возникнуть как указание на выходца из этих мест — Мегер вместо «Мегерский» или «Мегеров», по модели «Тамбов» → «Тамбов» (редко, но бывало в крестьянской среде). В пользу этой гипотезы говорит то, что в переписях XIX века фамилия Мегер изредка встречается именно в Олонецкой и Вологодской губерниях.

Словообразовательно фамилия проста: корень «мегер-», нулевое окончание. Ударение, скорее всего, на первый слог — Ме́гер, хотя в разговорной речи могли ставить и на второй. Аналогов в русском языке мало: можно вспомнить фамилии Ветер, Кобер, Шустер — все они либо прозвища, либо заимствования.

О сословной принадлежности сказать сложно: Мегеры не фигурируют в родословных книгах дворянства. Скорее всего, фамилия крестьянская или мещанская, возникшая в северных регионах. В советское время она почти исчезла — по данным современных справочников, носителей в России единицы. Если вы носите эту фамилию, скорее всего, ваши предки были либо уроженцами Русского Севера, либо потомками переселенцев из Прибалтики или Финляндии (где фамилия Мегер встречается как вариант немецкого Meger или эстонского Mägi).