Фамилия Мегрян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -ян. В армянской ономастике этот суффикс выполняет ту же роль, что русские -ов/-ев или -ин: он указывает на принадлежность к роду, буквально означая «из семьи такого-то» или «потомок такого-то». Соответственно, основа Мегр- восходит к личному имени или прозвищу.

Наиболее вероятная версия связывает основу с армянским именем Мегр (или Мегра), которое, в свою очередь, происходит от слова «мег» — «мёд». В древности мёд был не только сладостью, но и символом сладости, приятности, достатка. Имя Мегр могло даваться ребёнку как пожелание сладкой, благополучной жизни, или же быть прозвищем человека с мягким, «сладким» характером. Встречаются в армянских источниках и формы Меграбян, Мегрунян — все они однокоренные.

Менее распространённая, но тоже возможная версия — топонимическое происхождение. В Армении есть село Меграшен (буквально «построенный Мегром»), а также область Мегри на юге страны, на границе с Ираном. Фамилия Мегрян могла возникнуть у выходца из этих мест, особенно учитывая, что суффикс -ян в армянском языке также может указывать на географическую принадлежность.

Социальный контекст фамилии типичен для армянского крестьянства и городских ремесленников. В отличие от русских фамилий, где суффикс мог указывать на сословие (например, -ский у дворян), армянский -ян не нёс сословной нагрузки и встречался у всех слоёв населения — от крестьянина до князя. Поэтому предки носителей фамилии Мегрян могли быть и земледельцами, и пасечниками (что логично вытекает из «медовой» основы), и торговцами.

В написании фамилии возможен вариант Мегрянц (с конечным -ц, что свойственно диалектам западных армян), но в русскоязычной среде закрепилась форма на -ян. Фамилия не относится к числу самых частых, но встречается как в Армении, так и в армянских диаспорах России, США, Франции.