Фамилия Меличин звучит непривычно, и это не случайно: её основа, скорее всего, связана не с русским, а с южнославянским или западнославянским именем. В русском языке нет корня «мелич-» со значением, от которого можно было бы легко образовать прозвище или профессию. Поэтому главная версия — перед нами фамилия, пришедшая из сербской, хорватской или словенской среды.

В основе лежит уменьшительная форма имени Милош или Милан — Милич (Milić) или Мелич (Melić). В славянских языках суффикс -ич (русский аналог — -ин) указывает на принадлежность: «сын Милича» или «потомок Меля». Когда такая фамилия попала в Россию, её могли русифицировать, заменив типичное для южных славян окончание -ич на русское -ин. Так Милич превратился в Меличина. Подтверждает эту гипотезу и то, что в сербских и хорватских фамилиях корень «Мел-» встречается часто, а в русском ономастиконе он редок.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с прозвищем от слова «мель» или «мелкий». В северных русских говорах «меличить» могло означать «делать мелким, дробить», отсюда прозвище Меличка — человек маленького роста или въедливый, дотошный. Однако для прозвищного происхождения фамилия должна была бы иметь суффикс -ов или -ев (Меличков), а не -ин. Форма Меличин указывает именно на патроним (отчество), то есть на имя отца.

В дореволюционных метрических книгах фамилия Меличин встречается эпизодически, чаще всего в южных губерниях Российской империи и в городах, где селились выходцы с Балкан. Носители могли быть потомками сербских или болгарских переселенцев, оказавшихся в России после русско-турецких войн. Сословной привязки у фамилии нет: её могли носить и купцы, и крестьяне, и мещане — всё зависело от того, кто именно из Миличей обосновался на новом месте.