Фамилия Мелказерова — яркий пример того, как редкое прозвище, данное человеку по характерной черте, закрепилось в родовом имени. В основе фамилии лежит прилагательное «мелкий» и существительное «зерно». Прямое значение — «мелкое зерно». Скорее всего, так в крестьянской среде могли прозвать человека, который занимался отбором или сортировкой зерна, либо того, чей хлеб или посев давал мелкое, некачественное зерно. Реже прозвище могло относиться к человеку прижимистому, скупому, который «экономит до последнего зернышка», но эта версия менее вероятна: прозвища обычно отражали внешнюю, видимую особенность или занятие, а не внутренние качества.

Фамилия образована по стандартной модели: от прозвища Мелкозер (или Мелкозеро) с помощью притяжательного суффикса -ов, который указывал на принадлежность к главе семьи. Женская форма Мелказерова — это вариант, закрепившийся за женщинами, тогда как мужская форма — Мелказеров. Написание через «а» (Мелказеров, а не Мелкозеров) — результат исторического процесса «аканья», когда безударный звук «о» стал произноситься и писаться как «а». Это типично для южнорусских и среднерусских говоров, что указывает на возможное происхождение предков из этих регионов.

Фамилия очень редкая. Встречается преимущественно в центральных и южных областях России, а также в Поволжье. В дореволюционных переписях и метрических книгах она не была широко распространена, что говорит о её локальном, «гнездовом» характере: скорее всего, все носители происходят от одного основателя, получившего такое прозвище в конкретной деревне или волости.

Словообразовательная модель «прилагательное + существительное» в основе прозвища — не самая частая для русских фамилий. Сравните с более известными, но тоже редкими аналогами: Белозёров, Краснозёров, Толстозёров. В отличие от них, фамилия Мелказеров не имеет поэтического или метафорического оттенка — она сугубо бытовая, утилитарная, что подтверждает её крестьянское, «низовое» происхождение. Никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.