По одной из версий, фамилия Мелкозёров связана с гидронимом Мелкое озеро: такое официальное название носит одно из озер, относящееся к бассейну реки Исети (в 5,5 км южнее города Среднеуральска). Возможно, основатель рода Мелкозёровых жил на берегу этого водоема. Однако прозвище Мелкозёр могло быть и не связано с конкретным озером: как известно, мелкие озера были в изобилии на всей территории России, Украины и Белоруссии. В любом случае, это прозвище указывало на место жительства человека: на берегу мелкого озера. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Мелкозёр, со временем получил фамилию Мелкозёров.