Фамилия Менер — редкая и неоднозначная для русского уха. В ней нет привычных славянских суффиксов -ов, -ин или -ский, поэтому сразу понятно: перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная, адаптированная в разное время и разными путями.

Самый вероятный источник — немецкая фамилия Mähner или Mehner. В основе лежит средневерхненемецкое mane (луна) или man (человек, мужчина). В первом случае предок мог получить прозвище по лунному серпу — например, за форму подбородка или за работу, связанную с ночным временем. Во втором случае фамилия могла означать «мужественный» или просто указывать на мужчину как на главу семьи. В немецкой ономастике такие фамилии часто возникали из прозвищ, а не из ремёсел.

Вторая версия — тюркское или кавказское происхождение. В тюркских языках «мен» означает «родинка», а суффикс -ер указывает на обладателя: Менер — «тот, у кого родинка». Такая модель распространена среди татар, башкир и народов Северного Кавказа. В пользу этой версии говорит то, что фамилия встречается у поволжских татар и в некоторых районах Башкортостана.

Третья, более экзотическая гипотеза — еврейское происхождение от идишского מענער (менер), что значит «мужчины» или «люди». В таком случае фамилия могла быть искусственной, данной при записи в метрические книги, или образованной от прозвища многодетного отца.

География бытования фамилии в России сегодня — в основном крупные города (Москва, Санкт-Петербург) и отдельные очаги в Татарстане и Башкортостане. В Европе немецкий вариант Mähner сконцентрирован в Саксонии и Тюрингии.

Какую из версий выбрать — зависит от семейного предания. Если в роду помнят о немецких корнях, скорее всего, это вариант Mähner. Если есть связь с татарскими или башкирскими предками — тюркская версия. Если же никаких легенд не сохранилось, логичнее остановиться на немецкой: она лучше документирована в ономастических словарях и встречается в исторических записях XVIII–XIX веков среди переселенцев в Российскую империю.