Фамилия Меншутин отвечает на вопрос «чей?» и образована от личного имени или прозвища Меншута. В основе лежит древнерусское слово «меньший», то есть «маленький». Чаще всего Меншутой называли младшего ребёнка в семье, того, кто родился позже остальных детей. Такое имя-оберег давали не случайно: считалось, что если назвать ребёнка «меньшим», он не будет обделён вниманием и вырастет под защитой старших родственников.

Суффикс -ут- придаёт основе уменьшительно-ласкательный оттенок, как в словах «толстута» или «малута». Формант -ин в фамилии указывает на принадлежность: Меншутин буквально значит «сын Меншуты». По этой же модели построены фамилии Малутин, Старутин, а вот Меньшутин с мягким знаком встречается реже и считается более поздним вариантом написания.

Существует и вторая версия происхождения. Согласно ей, Меншута — не имя, а прозвище невысокого, миниатюрного человека. В этом случае фамилия закрепляла внешнюю особенность родоначальника, а не его место среди братьев и сестёр. Обе гипотезы правдоподобны, но первая выглядит убедительнее: в старину имена по старшинству были широко распространены, и «Меньшой» встречается в документах с XV века как полноценное личное имя.

Фамилия Меншутин бытует преимущественно в центральных и северных регионах России, что типично для имён с суффиксом -ут-. В переписных книгах XVII века такие формы встречаются среди крестьян и посадских людей, то есть фамилия не была дворянской, а возникла в народной среде.

Среди носителей фамилии есть Герой Советского Союза Евгений Петрович Меншутин (1922–1978). Он прошёл Великую Отечественную войну, командовал стрелковым батальоном и получил звание за мужество при форсировании Днепра. Его биография — редкий документально подтверждённый след фамилии в истории XX века.