Фамилия Мензерский — относительно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от географического названия, и в этом случае ключ к разгадке — суффикс «-ский». В русской ономастике такие фамилии традиционно указывают на связь с местностью: либо предок владел землёй (дворянский вариант), либо просто родился или жил в селе или городе с похожим названием.

Логичнее всего искать топонимическую основу. На карте России и сопредельных территорий нет крупного города «Мензерск», но можно предположить, что в основе лежит название небольшого населённого пункта, озера или реки. Например, в Поволжье и Приуралье есть гидронимы с корнем «мензел» (от тюркского «мензель» — станция, привал) или похожие названия вроде Мензелинска. Если фамилия происходит от названия села Мензеры или Мензери, то её носитель — выходец оттуда. В этом случае значение фамилии — «тот, кто родом из Мензер».

Нельзя исключать и вариант, что основа — фамилия Мензер (или прозвище Мензель), а суффикс «-ский» добавился позже, по аналогии, как это часто бывало в среде духовенства или при переходе из польской шляхты. Если исходное слово — немецкое «Menser» (человек, мужчина) или «Menzel» (уменьшительное от имени), то фамилия могла быть принесена переселенцами-немцами и адаптирована на русской почве. Однако для славянской фамилии «Мензерский» топонимическая версия выглядит предпочтительнее.

Сословная принадлежность предков Мензерских не очевидна. Фамилии на «-ский» в Российской империи давали не только дворянам, но и, например, семинаристам, а также крестьянам, переселявшимся из одного села в другое и получавшим прозвище по старому месту жительства. Скорее всего, основатели фамилии не принадлежали к высшей аристократии, иначе название было бы лучше задокументировано. Это фамилия «местная», указывающая на конкретный, возможно, уже исчезнувший или переименованный хутор или деревню.

В современной России фамилия встречается спорадически, без ярко выраженного регионального центра. Это подтверждает версию о её происхождении от небольшого локального топонима, который не сохранился в памяти большинства.