Фамилия Месенев (в написании через ё — Месенёв) образована от личного прозвища Месень и относится к распространённому типу русских фамилий на -ев. Разберём, что стояло за этим прозвищем.

Слово «месень» в старину имело несколько значений. В говорах так называли корм для животных и птиц — сечку с отрубями или мякиной. Если прозвище дали по этому значению, предок мог быть скотоводом или изготовителем кормов. В некоторых диалектах «месень» означала грязь, топкое место — тогда прозвище могло закрепиться за человеком, жившим в низкой, сырой местности.

Более вероятна другая версия — связь с глаголом «месить». В. И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет его как «мять, комкать, толочь, перемешивать». В таком случае Месенем называли человека по роду занятий: тестомеса, рабочего на месильне (месильном заводе, где замешивали глину для черепицы или тесто). Это «профессиональное» именование — один из самых частых источников русских фамилий, поэтому версия выглядит правдоподобнее остальных.

Суффикс -ев указывает на притяжательную форму: Месенев буквально значит «сын Месеня». Так потомки человека с прозвищем Месень со временем получили фамилию. Написание через ё (Месенёв) — орфографический вариант, не меняющий ни происхождения, ни значения: ударение в обоих случаях падает на последний слог.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий и не всегда был привязан к одной местности. Окончательные выводы возможны только после серьёзных генеалогических исследований. Но уже сейчас ясно, что фамилия Месенев — самобытный памятник славянской культуры, сохранивший память о прозвище, которое могло рассказать и о ремесле, и о быте предка.