Фамилия Мескин чаще всего звучит как прозвище, а не как наследственное имя. Если ударение падает на первый слог, перед нами украинская модель: от прозвища Меска, а в основе — слово «меск», то есть «мул». Мул — это гибрид кобылы и осла, который взял от матери крупное тело и резвость, а от отца — выносливость и редкую работоспособность. Поэтому прозвище Меска могло достаться человеку широкоплечему и сильному, либо терпеливому и стойкому по характеру. Не исключено, что так звали работящего мужика с отменным здоровьем, способного много и хорошо трудиться. Впрочем, основатель рода мог и буквально держать мулов — заниматься животноводством или использовать их в поле.

Сложнее, если ударение смещается на последний слог. Тогда этимология разветвляется. По одной версии, Мескин восходит к еврейскому женскому имени Meske — уменьшительной форме от Miryam, что значит «желанный». Так могли назвать долгожданного ребёнка, и фамилия сохранила память об этом. По другой версии, корень арабский: «meskīn» переводится как «бедный». В этом случае прозвище Мескин указывало бы на социальное положение предка — небогатого человека. Обе гипотезы имеют право на жизнь, но первая выглядит убедительнее: имя-основа встречается в фамилиях чаще, чем характеристика достатка, хотя и тот вариант нельзя сбрасывать со счетов.

Сам суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: Мескин — это «сын Мески», «человек из рода Мескиных». Такая модель типична для северных и центральных русских говоров, где фамилии на -ин образовывались от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а. Получается, что независимо от того, какая версия верна, фамилия сохранила в себе личное имя или прозвище родоначальника, а потомки со временем закрепили его как родовое имя.