Фамилия Микакилов — редкая и морфологически прозрачная, но с неочевидной основой. Она образована по модели «основа + суффикс -ов», который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Микакилов, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Микакил. Суффикс -ов характерен для русской фамильной системы, но сама основа явно не славянского происхождения. Это первый ключ к разгадке: перед нами фамилия, возникшая в среде, где русская словообразовательная модель наложилась на иноязычное личное имя.

Вероятнее всего, в основе лежит имя Микакил — вариант или производная форма от библейского имени Михаил (Микаил), распространённого у народов, исповедующих ислам. В тюркских и кавказских языках, особенно в азербайджанском, дагестанских и татарском, имя Микаил (Микайыл, Микакил) — это архангел Михаил в коранической традиции. Форма Микакил могла возникнуть в результате диалектного удвоения или народной этимологии: звук «к» мог усилиться под влиянием других имён (например, Исмаил — Исмакил?). Таким образом, Микакилов — это «сын Микакила», то есть потомок человека, носившего это имя.

Географически фамилия тяготеет к регионам Северного Кавказа и Закавказья, особенно к Дагестану и Азербайджану. В русских переписных книгах и метриках она практически не встречается, что подтверждает её позднее вхождение в русский фамильный фонд — скорее всего, в XIX–XX веках, при фиксации фамилий у горских народов. Учитывая суффикс -ов, можно предположить, что носители фамилии были выходцами из среды, где русская административная машина записывала фамилии по «великорусскому» образцу, заменяя местные окончания (-лы, -оглы) на стандартные.

Спорных версий немного. Можно было бы предположить связь с греческим именем Микакис (уменьшительное от Михаил), но суффикс -ов и отсутствие фамилии в греческой среде делают эту гипотезу маловероятной. Также маловероятна связь с тюркским словом «мика» (в значении «гнилой» или «плохой») — это дало бы фамилию с негативным оттенком, что для личных имён нетипично. Основная версия — имя Микакил как форма Михаила — остаётся самой правдоподобной.

Социальный контекст фамилии Микакилов указывает на крестьянское или горское происхождение: в среде дворянства и духовенства такие фамилии не фиксируются. Она не получила широкого распространения и осталась локальной, что делает её ценным маркером для генеалогического поиска — каждый носитель, скорее всего, имеет общих предков в пределах одного-двух аулов или сёл.