Фамилия Микайил — редкий случай в русском ономастиконе. Она не укладывается в привычную модель русских фамилий с суффиксами -ов, -ин или -ский. Её основа — личное имя Микайил, которое является одной из форм имени Михаил, восходящей к древнееврейскому «Микаэль» — «кто как Бог». В русской традиции это имя известно в церковнославянском варианте Михаил, но в тюркских и кавказских языках, испытавших влияние ислама, закрепилась форма Микайил (Микаил) — так зовут одного из архангелов в Коране.

Скорее всего, фамилия Микайил — это не русифицированная, а напрямую заимствованная форма, сохранившая исходное звучание. Такие фамилии характерны для народов Северного Кавказа, Закавказья и тюркских групп, где имя Микайил популярно. В русском контексте она могла появиться как транслитерация паспортной записи, без добавления типичных суффиксов, что указывает на относительно позднюю фиксацию — в XIX–XX веках, когда представители нерусских национальностей получали фамилии по отцу или деду без переоформления на славянский лад.

Географически фамилия Микайил встречается в Дагестане, Чечне, Азербайджане, а также среди татар и башкир. В этих регионах имя Микайил давали в честь пророка или ангела, и фамилия образовывалась по модели «имя отца — фамилия сына», что типично для патронимических систем. Например, у аварцев или лезгин фамилия могла возникнуть как Микайилов, но вариант без суффикса тоже возможен, если запись вели в национальной традиции.

Словообразовательно фамилия Микайил стоит особняком: в ней нет суффиксов принадлежности, которые указывали бы на русского носителя. Это прямая основа, которая не склоняется по падежам в мужском роде, что роднит её с фамилиями типа Карапетян или Ахмед, но отличает от подавляющего большинства русских фамилий. Если предки носили такую фамилию, они, скорее всего, были связаны с мусульманской или христианской восточной культурой, но точнее определить этническую принадлежность можно только по региону проживания.

Встречаются также варианты написания — Микаил, Микайылов, Микаилов. Второй и третий варианты уже адаптированы под русскую грамматику, а чистая форма Микайил сохраняет исходное имя как фамилию, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска: она прямо указывает на имя предка-основателя.