Фамилия Михайков — нечастая, но прозрачная по происхождению. В её основе лежит имя Михайло — народная форма крестильного имени Михаил (в переводе с древнееврейского «кто как Бог»). В русских говорах форма Михайло была широко распространена, особенно в северных и центральных губерниях, и фамилии от неё образовывали по-разному: Михайлов — самая частая, а Михайков и Михайкин — более редкие варианты.

Вот тут и кроется особенность. Суффикс -к- в фамилии Михайков указывает не на типичную патронимическую модель («чей сын?»), а на уменьшительную или обиходную форму имени. Изначально Михайко — это не «сын Михайлы», а сам Михайло, но названный по-домашнему, по-свойски. Такие формы на -ко (Петро, Ивашко, Михайко) в XVI–XVII веках активно бытовали в южнорусских и украинских землях, а затем закрепились как фамилии с окончанием -ов по общерусскому образцу. То есть Михайков — это «потомок того, кого звали Михайко».

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: основа могла быть не от имени, а от прозвища Михай, Михайка — так в некоторых областях называли медведя (от «мишка»), но это скорее исключение. Основная масса носителей фамилии — потомки человека по имени Михайло.

Географически фамилия встречается разрозненно, но заметна в Смоленской, Брянской областях и на юге России — в бывших казачьих землях. В переписных книгах XVII века попадаются Михайковы среди крестьян и посадских людей, дворянских ветвей не зафиксировано. Фамилия не знатная, но прочная, живая, без перерыва передавалась из поколения в поколение — и дошла до наших дней в том же звучании, как и триста лет назад.