Фамилия Михайкова — женская форма фамилии Михайков, и её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем, от которого образована мужская версия. Разбирать её стоит через суффикс и основу, чтобы сразу понять, откуда пошёл род.

Основа фамилии — «Михайк(о)». Это уменьшительная форма от крестильного имени Михаил. В русской ономастике суффикс -к- (в сочетании с окончанием -о или -а) широко использовался для образования обиходных, «домашних» имён: Михайло превращалось в Михайку, как Иван — в Ивашку, а Пётр — в Петрушку. Такие формы в XV–XVII веках часто становились прозвищами, а затем и фамилиями, особенно в среде крестьян и посадских людей, где полное церковное имя в быту заменяли сокращённым.

Суффикс -ов в мужской фамилии Михайков указывает на притяжательное значение: «чей?» — «Михайков», то есть сын, потомок или человек из семьи Михайка. Типичная модель для русских фамилий, сложившаяся к концу XVII — началу XVIII века. Женская форма Михайкова, таким образом, означает «дочь или жена Михайкова».

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России. В переписных книгах и метриках XVII–XIX веков Михайковы чаще всего встречаются в бывших Архангельской, Вологодской и Пермской губерниях, а также в Поволжье. Это объясняется широкой распространённостью имени Михаил среди крестьянского и мещанского сословий — святых покровителей этого имени почитали повсеместно.

Отдельного внимания заслуживает вариант написания: в некоторых старых документах фамилию могли фиксировать как «Михайкова» через «е» — «Михейкова», если в основе лежало имя Михей (тоже каноническое, но более редкое). Однако для фамилии Михайкова версия с корнем от Михаила основная и статистически преобладающая. Спорных гипотез здесь нет: лингвисты сходятся на том, что это типичный пример «патронимической» фамилии от уменьшительного имени, без дополнительных прозвищных или ремесленных значений. Предки носительницы фамилии были, скорее всего, крестьянами или посадскими людьми, а само имя Михайка в быту звучало ласково или фамильярно — в зависимости от контекста.