Фамилия Михели — редкий для России случай, когда фамилия не обросла типовым русским суффиксом. В ней нет окончаний -ов, -ин или -ский, поэтому её происхождение почти всегда связано с нерусской языковой средой, а именно с грузинской.

В грузинском языке суффикс -ели указывает на принадлежность к месту или роду. Основа «Михе» — это грузинская форма имени Михаил (მიხეილ, Михеил). Таким образом, Михели дословно означает «Михаилов» или «из рода Михаила». Это типичная модель для грузинских фамилий: Геловани (от Гела), Церетели (от Церет) и так далее. Носитель такой фамилии — потомок человека по имени Михе (Михаил).

Встречается и другая, менее вероятная версия: связь с греческим корнем «михе» — «маленький» или «мелкий». Но для греческой ономастики характерны другие суффиксы (например, -пулос, -идис), а форма на -ели — это грузинский маркер. Поэтому версия с уменьшительным прозвищем в греческом языке слабая и не имеет под собой надёжной опоры в словарях.

Географически фамилия Михели сосредоточена в Западной Грузии — в регионе Самегрело (Мегрелия). Там суффикс -ели особенно распространён. В России фамилия встречается редко, её носители — в основном потомки грузинских переселенцев советского времени или люди, чьи предки сменили фамилию при переезде, отбросив русифицированное окончание.

В отличие от фамилий, где корень затемнён или утерян, Михели прозрачна: она прямо указывает на имя предка. Социальный статус тут не зашифрован — это не прозвище по ремеслу или внешности, а чистая отчество-родовая модель, которая в Грузии могла принадлежать и крестьянину, и князю, в зависимости от конкретного рода.