Фамилия Микитбаев встречается нечасто, но её происхождение прослеживается довольно прозрачно. В её основе лежит личное имя Микитбай, которое представляет собой сложение двух тюркских компонентов: «Микит» и «бай». Первая часть — это адаптированная в тюркской среде форма христианского имени Никита (через греческое Никитас — «победитель»). Вторая часть — «бай» (в тюркских языках «господин», «богач», «хозяин»). Таким образом, имя Микитбай буквально означало «господин Микит» или «богатый, как Микит», а фамилия Микитбаев — «потомок Микитбая».

Суффикс «-ев» в этой фамилии — стандартный русский патронимический формант, который в XIX–XX веках добавляли к тюркским именам при оформлении фамилий для жителей Российской империи. Наличие именно этого суффикса (а не, скажем, «-улы» или «-оглы») указывает на то, что фамилия формировалась уже в русскоязычной административной среде, скорее всего, в Оренбургской, Уфимской или Казанской губерниях, где были сильны башкирские и татарские общины.

Словообразовательная модель здесь типична для так называемых «антропонимических гибридов»: тюркское имя на христианской основе плюс тюркский титул, а затем русский суффикс. Интересно, что вторая часть «-бай» в составе фамилии встречается и в других именах (Акбай, Уразбай, Туктабай), но сочетание с «Микит» встречается редко — это указывает на то, что исходное имя было не массовым, а скорее индивидуальным прозвищем или именем, данным конкретному человеку.

По социальному происхождению носители фамилии Микитбаев, скорее всего, относились к податным сословиям — государственным крестьянам, тептярям или башкирам-вотчинникам. Дворянской фамилией она не была: в родословных книгах Российской империи такие окончания на «-ев» от тюркских основ встречаются у простых крестьян и мелких торговцев. Если искать параллели, то однокоренными можно считать фамилии Микитов, Микитин (от русского Никита) и Микитбеков (где «бек» вместо «бай»), но Микитбаев стоит особняком из-за именно башкирско-татарского компонента «бай».