Фамилия Миклер, скорее всего, — фонетический вариант более распространенной фамилии Меклер. Разница в написании возникла из-за того, как по-разному слышали и передавали звук [е] в безударной позиции: он редуцировался и звучал ближе к [и]. Поэтому при записи фамилии в документах и закрепился вариант с буквой «и».

Основа у обеих форм одна — прозвище Меклер. Оно восходит либо к нижненемецкому слову mekeler, либо к идишскому mekler. И в том, и в другом языке это слово значит одно и то же — «посредник». Такое прозвище относилось к разряду «профессиональных» именований: на Руси, где оседали выходцы из немецких земель и еврейских местечек, за человеком закреплялось название его занятия. Посредник в торговых сделках, маклер, сводник при заключении договоров — все это один ряд значений, который и лег в основу фамилии.

Иначе говоря, основатель рода Миклер был человеком, который сводил продавца с покупателем, помогал сторонам договориться, выступал доверенным лицом в делах. В сословном обществе такое занятие не считалось ремеслом в привычном смысле, но давало неплохой доход и требовало репутации честного человека — иначе к посреднику просто не пошли бы.

Сама модель образования проста: прозвище Меклер без изменений перешло в фамилию, а затем под влиянием произношения трансформировалось в Миклер. Суффиксальной приставки, как в русских фамилиях на -ов или -ин, здесь нет — это типичный случай для фамилий, возникших из западноевропейских или идишских прозвищ, которые часто сохраняли исходную форму.