Фамилия Миклушка — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от популярных фамилий на -ов или -ин, она сохранила в основе не крестильное имя, а прозвище, причём, скорее всего, украинского или белорусского корня.

Если разбирать словообразовательную модель, то сразу бросается в глаза суффикс -ушк-/-юшк-. В восточнославянских языках он часто придаёт слову уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный оттенок. Соответственно, Миклушка — это производное от личного имени Микла или Микло. Самое вероятное объяснение: Микла — это народная, диалектная форма канонического имени Николай (через форму Микола, где «н» отпало в начале слова). В украинском языке «Микола» — обычное звучание, а «Миклушка» — его ласкательный вариант. Таким образом, предок носителя фамилии был, попросту говоря, «Николашкой» или «Коленькой» на местный манер.

Вторая, менее очевидная, но тоже возможная версия отталкивается от глагола «мигать» или «мигнуть». В некоторых западных говорах «миклуша» или «миклушка» могло означать человека, который часто моргает, щурится или имеет привычку «мигать» глазами. Прозвища по физическим особенностям — один из древнейших пластов фамилий, так что этот вариант тоже имеет право на существование, хотя встречается реже.

Географически фамилия Миклушка тяготеет к западу: чаще всего она встречается в Украине, особенно в западных областях, и в южных регионах Беларуси. В России она — большая редкость, и если и попадается, то, скорее всего, у потомков переселенцев с Украины. Эта региональная привязка — ключевая деталь: она сразу отсекает версию о происхождении от великорусского «Михаил» (который дал бы форму Мишутка или Михалка).

Социальный контекст тоже прост: фамилия образована не по модели дворянского или церковного сословия, а в крестьянской или казачьей среде, где прозвища давали по имени-оберегу или по внешней черте. Никаких «-ских» или «-овичей» — перед нами чисто народная, бытовая фамилия, которая закрепилась в документах, скорее всего, в XVII–XVIII веках, когда на Украине и в Беларуси шла массовая фиксация прозвищ в качестве наследственных фамилий.

Итог: фамилия Миклушка — это либо ласкательное «Николай» на украинский лад, либо прозвище человека с характерной манерой моргать. Первая версия надёжнее и встречается чаще, вторая — возможна, но требует доказательств в конкретном роду.