Фамилия Милушкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Милушкин послужило мирское имя Милушка. Мирское имя Милушка восходит к прилагательному «милый». Вероятно, так прозвали горячо любимого ребёнка, милого, приятного своим родителям. Однако не исключено, что в основе фамилии Милушкин лежит не мирское имя, а прозвище Милушка, которое получил человек с кротким нравом, добродушный, незлобливый или же миловидный, симпатичный. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Милушка, со временем получил фамилию Милушкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Милушкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Милушкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.