Фамилия Милюхин — живой памятник славянского имени-прозвища, и её разбор показывает, как личное прозвище превращалось в наследственное имя. В основе лежит прозвище Милюха, которое восходит к общеславянскому корню мил- и прилагательному «милый». Такие имена давали не столько за внешность, сколько за характер: так могли назвать ласкового, доброго, обходительного человека, а иногда — в ироничном ключе, когда поведение резко расходилось с прозвищем.

Однако у Милюхи есть и вторая, менее очевидная версия происхождения. Корень мил- мог входить в состав древнерусских канонических имен вроде Милонег или Милорад, которые после усечения давали уменьшительную форму Милюха. В этом случае фамилия сохранила бы память о старом славянском имени, а не о прозвище. Обе гипотезы имеют право на жизнь, но первая — от прозвища по характеру — выглядит правдоподобнее: она проще и лучше согласуется с тем, как в реальности работала народная антропонимия.

Суффикс -ин в фамилии указывает на модель «чей сын»: Милюхин значит «сын Милюхи». Такой способ образования был типичен для русских фамилий на севере и в центральных областях России, где притяжательные прилагательные с -ин закрепились раньше и плотнее, чем на юге. Поэтому носители фамилии чаще встречаются в регионах с древней новгородской и ростово-суздальской колонизацией, хотя точную географию расселения Милюхиных сейчас восстановить сложно.

Написание фамилии устойчиво, но в старых документах можно встретить варианты Милюхин и Милюхинъ с твёрдым знаком на конце — это следы дореформенной орфографии, а не отдельная фамилия. Родственными по основе будут Милюков, Милютин, Миляев: все они образованы от разных уменьшительных форм того же корня мил-, и их носители могли быть однофамильцами в самом буквальном смысле — потомками разных людей с похожими прозвищами.

О точном времени возникновения фамилии говорить не приходится: процесс закрепления прозвищ за потомками растянулся на столетия, и в каждом регионе он шёл своим темпом. Прозвище Милюха могло возникнуть в любой период с XIV по XVII век, а фамилия закрепилась, когда внуки и правнуки перестали менять именование по отцу. Несмотря на неопределённость дат, фамилия Милюхин остаётся образцом того, как простое слово о характере человека превратилось в семейное имя, пережившее века.