Фамилия Милюшенков — редкий пример, где суффиксальная цепочка перевешивает по информативности саму основу. Разберем её по частям, и станет ясно, почему это не просто «сын Милюши».

Основа — Милюша. Это не каноническое церковное имя, а производная форма от крестильного имени Емилиан (в просторечии — Миля, Милюта, Милюша). В русской народной традиции имя Емилиан сокращали до Миля, а далее добавляли уменьшительный суффикс -юш-, как в именах Ванюша, Катюша. Так что Милюша — это ласковое, домашнее прозвище для Емилиана. Реже, но возможно, что основа восходит к глаголу «миловать» (жалеть, ласкать) — тогда Милюшей могли назвать ласкового, доброго человека.

Главная особенность фамилии — суффикс -енков. Это типичный восточноукраинский и южнорусский патронимический формант, распространённый в бывших Слободской Украине и Курской, Воронежской, Белгородской губерниях. В отличие от великорусского -ов/-ев, суффикс -енков означает не просто «принадлежащий», а «маленький, младший сын» или «внук». То есть Милюшенков — это буквально «Милюшин внук» или «сын Милюши». Двойной суффикс (-ен- + -к- + -ов) подчёркивает, что фамилия оформилась в среде, где патронимы на -енко были нормой, а потом, при русификации, к ним добавили типичное русское окончание -ов.

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины. Это не дворянская и не купеческая фамилия — она сложилась в крестьянской или казачьей среде, где прозвища по отцу были главным способом идентификации. В метрических книгах XIX века Милюшенковы встречаются в основном в Харьковской и Курской губерниях.

В написании стоит обратить внимание на беглый гласный: в основе Милюш- при добавлении суффикса -енков не происходит выпадения звука, как, например, в фамилии Милюшин (от Милюша). Это говорит о том, что фамилия фиксировалась уже в письменной форме, а не через устную передачу, где -ш- могло бы смягчиться.

Коротко: если вы Милюшенков, ваши предки — скорее всего, крестьяне или казаки с юга России, а фамилия означает «потомок Милюши», то есть Емилиана.