Фамилия Миниченко — характерный пример украинской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -енко. В украинской ономастике этот суффикс указывал на происхождение по отцу: Миниченко значит «сын Минича» или «потомок Минича». Сама основа Минич — это отчество или прозвище, восходящее к уменьшительной форме имени Миня. Такое имя было распространено в народной среде как сокращение от полных имен Дмитрий, Минай или Мирон. В быту крестьянина или ремесленника XV–XVII веков «Миня» звучало привычнее, чем полное имя, а отчество Минич закреплялось за сыном.

С точки зрения географии, фамилия Миниченко тяготеет к левобережной Украине и южным регионам России, куда в XVIII–XIX веках переселялись украинские казаки и крестьяне. Встречается она в Черниговской, Полтавской, Харьковской губерниях, а также в Курской и Воронежской областях. Это не случайно: именно в этих местах активно шла колонизация земель, и фамилии на -енко фиксировались в ревизских сказках как маркер украинского происхождения.

Спорных версий у Миниченко немного. Иногда основу пытаются связать с глаголом «минуть» или словом «минута», но это фонетическое совпадение, не имеющее смысловой поддержки. Гораздо правдоподобнее версия, что Миниченко — вариант фамилии Минченко, где чередование «и/е» объясняется диалектным произношением в южнорусских говорах. В документах XIX века можно встретить оба написания, но Миниченко закрепилось как более редкая, «акающая» форма.

По социальному составу носители Миниченко в основном принадлежали к казачьему и крестьянскому сословию. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её народное происхождение. Предок современного Миниченко, скорее всего, был рядовым казаком или хлеборобом, а его сына в документах записывали по отцу — Миничем, а внука уже Миниченко.