Первая из них восходит к мужскому тюркскому имени Минни, которое в переводе с арабского означает «помощник, друг, товарищ, творящий добро». Вторая часть ведет свое начало от тюркского «хан» - «правитель, властитель, монарх». Первоначально «хан» обозначал вождя племени (например, у кочевников Ирана и Афганистана). Таким образом, фамилия Минниханов буквально означает «творящий добро правитель». Вероятно, основатель фамилии был влиятельным, могущественным человеком и отличался своей добротой, широтой души.