Фамилия Миноченкова — женская форма от Миноченков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Миночка. В русской ономастике суффикс -к(а) часто указывал на уменьшительно-ласкательную форму, а конечное -ов типично для фамилий, возникших как притяжательные прилагательные: «чей?» — Миноченков, то есть сын или потомок Миночки.

Самая вероятная основа — мужское имя Мина, которое имеет греческие корни (Μηνάς) и связано с названием месяца, но в православной традиции закрепилось как имя нескольких святых. В народной речи имя Мина легко превращалось в Миночка, а затем в фамилию. Реже Миночка могло быть прозвищем от глагола «минуть» (миновать) или от слова «мина» (выражение лица), но в крестьянской среде, где фамилии чаще возникали от имён, первый вариант убедительнее.

Суффикс -енк- в основе «Миноченков» выдаёт западнорусское или украинское влияние. В говорах Смоленщины, Брянщины, а также на территории современной Беларуси и Украины форма с -енк- (Миноченко) была популярна, а при переходе в великорусскую среду к ней добавили типичный русский суффикс -ов. Таким образом, Миноченков — это гибридная фамилия, которая могла возникнуть на стыке культур: украинская или белорусская основа «Миноченко» обрусела при переселении носителя в центральные или северные губернии.

Фамилия редкая, не относится к числу массовых дворянских или купеческих. Её носители, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — людьми, которые несли сторожевую службу на южных границах и имели фамилии, образованные от уменьшительных имён. Встречаемость фамилии фиксируется в нескольких регионах: Курская, Орловская области, а также в некоторых районах Беларуси, что подтверждает её западнорусский след.

Словообразовательная цепочка проста: Мина → Миночка → Миноченко → Миноченков. Женская форма Миноченкова закрепилась как стандартная для замужних женщин в русской традиции, хотя в быту могла употребляться и без изменений — в зависимости от местного говора.