Фамилия Миншустин — одна из тех, где сразу заметна нетипичная для русского уха основа. Привычные суффиксы -ов/-ев или -ин здесь есть, но корень «Миншус» вызывает вопросы. Если отбросить фамильный суффикс -ин (указывающий на принадлежность: «чей?» — Миншустин), остается Миншус. Это, скорее всего, не славянское имя, а вариант записи восточного имени или прозвища.

Самый прямой путь — связать фамилию с тюркскими языками. В них «мин» (или «мен») часто означает «родинка», «знак», а также встречается как часть составных имен. «Шус» может быть искажением от «шуш» или «сус» — в некоторых тюркских диалектах это «тихий», «спокойный». Вполне вероятно, что Миншус — это прозвище, которое дали человеку со спокойным нравом и родинкой на лице, или же личное имя с похожей семантикой. В пользу тюркского происхождения говорит и то, что фамилия редка и не встречается в центральных областях России массово — ее очаги, судя по современным данным, тяготеют к Поволжью и Уралу, где исторически сильны тюркские влияния.

Менее вероятная, но возможная версия — искусственное происхождение. В XIX веке при переписях и выдаче метрик нерусское имя могли записать на слух, исказив до неузнаваемости. Например, если исходное имя было Миншариф (арабское «благородный знак») или Миншакыр («благодарный»), то при быстром произношении и записи малограмотным писарем оно могло превратиться в Миншус, а затем закрепиться как фамилия Миншустин. Суффикс -ин здесь стандартный, он просто указывает на сына или потомка человека по прозвищу Миншус.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Миншакиров, Миншарифов, Миннуллин — подтверждает, что корень «Мин-» в татарской и башкирской среде очень продуктивен. А вот «Миншустин» стоит особняком: в нем нет ни типичного тюркского суффикса -ов, ни арабского «улла». Это говорит о том, что фамилия могла сформироваться уже в русскоязычной среде, когда исходное имя осмыслили как прозвище на -ус (вроде Карасус, Токтус) и добавили русский патронимический суффикс. Так что предки носителя фамилии Миншустин, скорее всего, были тюркоязычными людьми (татарами, башкирами, чувашами), которые в XVIII–XIX веках перешли в русское сословие и получили фамилию по имени или прозвищу родоначальника.