Фамилия Мирагаев — редкий случай, когда географический и языковой следы почти не оставляют сомнений в происхождении. Её основа — тюркское мужское имя Мирага, которое распространено у народов Кавказа и Поволжья, особенно у азербайджанцев, лезгин и кумыков. Имя состоит из двух частей: «мир» (от арабского «эмир» — повелитель, князь) и «ага» (тюркское «господин, хозяин»). В сумме Мирага означает «господин-эмир» или «князь-господин» — составное имя-титул, подчёркивавшее знатность или уважение к носителю.

Русский суффикс -ев (а не -ов) указывает на то, что фамилия образована от основы, оканчивающейся на мягкий согласный или гласный, в данном случае от имени Мирага. Типичная модель: имя → притяжательное прилагательное («чей?» — Мирагаев) → фамилия. Такое оформление характерно для фамилий, возникших в среде, где тюркские имена адаптировались через русскую административную или церковную запись. В метрических книгах и ревизских сказках XIX века подобные фамилии часто фиксировались у крещёных татар, башкир или горских народов, переходивших в православие.

В отличие от более частых фамилий на -ов (Мирагов), форма Мирагаев встречается реже и устойчиво привязана к регионам с сильным тюркским субстратом — Дагестан, Азербайджан, Ставрополье, а также к татарским общинам Башкортостана. Интересно, что имя Мирага могло быть не только личным, но и прозвищем для уважаемого человека, например, сельского старосты или зажиточного хозяина, которого в округе называли «мир-ага» — «господин-князь». Со временем это прозвище закрепилось за потомками как фамилия.

Спорных версий немного. Некоторые пытаются связать первый слог «мир» с русским словом «мир» (спокойствие, община), но это маловероятно: в тюркских именах «мир» — последовательное заимствование из арабского, а не случайное совпадение. Также не стоит путать фамилию с Мираевыми или Мираевыми — там основа другая (от имени Мирай). Для Мирагаевых же ключ именно в сочетании «ага» и «эмир», которое чётко указывает на тюркскую аристократическую или почётную традицию именования.