Фамилия Миркискина — редкая, и её разбор требует внимания к суффиксальной части. Основа здесь — «Миркиск», а окончание «-а» указывает на женскую форму. Мужской вариант, таким образом, — Миркискин. Сама модель образования фамилии — через суффикс «-ин», который в русской ономастике традиционно присоединялся к основам, оканчивающимся на гласный или мягкий согласный, и означал принадлежность: «чей?» — Миркискин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Миркиска.

Ключевой вопрос — что такое «Миркиска». Скорее всего, это прозвище, образованное от имени Мирка или Мирко. В славянской антропонимии, особенно в южнорусских и украинских землях, усечённые формы имён на «-ко» (Мирко, Петро, Дмитро) были распространены. Имя Мирка могло быть производным от Мирослав, Миролюб или от канонического имени Мирон (в народной речи «Мирка»). Суффикс «-иск» в прозвище Миркиска — редкий и экспрессивный. В русских говорах суффикс «-иск(а)» придавал слову оттенок пренебрежения или, наоборот, шутливой фамильярности (сравните: «парниска», «мальчишка»). То есть Миркиска — это «маленький Мирка» или «этакий Мирка», прозвище с эмоциональной окраской, которое закрепилось за человеком из-за его роста, возраста или характера.

Альтернативная версия — топонимическое происхождение. Встречаются названия населённых пунктов с корнем «Мирк-» (например, село Мирки в Полтавской области или хутор Мирков в Ростовской области). В таком случае Миркискин — это «выходец из Мирок» или «житель Мирков», а суффикс «-иск» мог возникнуть в местном говоре как вариант притяжательного падежа. Однако эта версия менее вероятна, так как для фамилий-топонимов типичнее суффиксы «-ский» или «-ов».

Географически фамилия Миркискина тяготеет к югу России и Украине. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках Курской, Воронежской и Харьковской губерний изредка фиксировались носители фамилий с похожей структурой (Мирченко, Мирков, Миркин). Фамилия Миркискин и её женская форма Миркискина — явный признак крестьянского или мещанского сословия: дворянские роды с таким окончанием почти не встречаются. В советское время фамилия не исчезла, но осталась малочисленной — по современным базам данных, в России её носят буквально несколько десятков человек, в основном в Центральном Черноземье.

Таким образом, предок носителя фамилии Миркискина почти наверняка был крестьянином или ремесленником, которого в быту звали Миркиска — либо уменьшительно-ласкательно от имени Мирон или Мирослав, либо по месту жительства. Редкий суффикс «-иск» делает эту фамилию ярким примером народного словотворчества, где прозвище закрепилось именно в той экспрессивной форме, которая была привычна в его родной деревне.